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1、藥物：核心的主要骨架結構(母核起連接作用);與之相連接的基團或片段(又稱藥效團作用是與靶標結合)。

2、母核和各種基團或結構片段的改變不僅可以直接影響其與靶標的結合作用，從而影響藥效動力學和產(chǎn)生毒副作用;而且母核和各種基團或結構片段的結合和調整還會起到調節(jié)化合物理化性質、生物藥劑學性質和藥物動力學性質等作用。

3、基本骨架主要包括兩類：(1)一類是只含有碳氫原子的脂肪烴環(huán)、芳烴環(huán);(2)另一類是除含有碳氫原子外，還含有氮、氧、硫等雜原子的雜環(huán)。

母核和各種基團或結構片段的改變，影響藥物的各種性質(藥動學、藥效學、理化、生物藥劑學、毒副作用等)。

例如，羥甲戊二酰輔酶 A 還原酶抑制劑類降血脂藥物，洛伐他汀和辛伐他汀的母核均是六氫萘、氟伐他汀的母核是吲哚環(huán)、阿托伐他汀的母核是吡咯環(huán)、瑞舒伐他汀的母核是嘧啶環(huán)。在這類藥物的結構中， 3，5-二羥基羧酸是產(chǎn)生酶抑制活性的必需結構(藥效團)，氟伐他汀、阿托伐他汀、瑞舒伐他汀結構中均含有 3， 5-二羥基羧酸的結構片段，洛伐他汀和辛伐他汀的結構中含有的是 3-羥基-δ-內酯環(huán)的結構片段，該結構片段在體內會快速水解為 3，5-二羥基羧酸的藥效團。洛伐他汀、辛伐他汀、氟伐他汀、阿托伐他汀、瑞舒伐他汀結構中含有其他基團和結構片段可以起到增強藥物的藥效、改善溶解度或與酶的結合強度、改善藥物動力學性質等作用。

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