第三十條項目承擔單位根據與行業(yè)主管部門簽訂的項目任務書開展項目研究開發(fā)工作。

第三十一條項目執(zhí)行過程中實行重大事項報告制度。在項目實施期間出現(xiàn)項目計劃任務調整、項目負責人變更或調動單位、項目承擔單位變更等重大事項，項目負責人和項目承擔單位應當及時報行業(yè)主管部門批準。

第三十二條項目執(zhí)行的全過程中應當充分發(fā)揮委員會的咨詢評議作用。

第三十三條專項經費的撥付按照財政資金支付管理的有關規(guī)定執(zhí)行。經費使用中涉及政府采購的，按照政府采購有關規(guī)定執(zhí)行。

第三十四條項目承擔單位應當嚴格按照下達的項目預算執(zhí)行，一般不予調整。確有必要調整時，應當按照以下程序審批：

（一）項目預算、項目年度預算總額的調整應當報經財政部批準。

（二）項目支出預算科目中勞務費、專家咨詢費和管理費預算一般不予調整。其他支出科目，醫(yī)學教育網搜集|整理在不超過該科目核定預算10%，或超過10%但科目調整金額不超過5萬元的，由項目承擔單位根據研究需要調整執(zhí)行；其他支出科目預算執(zhí)行超過核定預算10%且金額在5萬元以上的，由項目承擔單位提出調整意見按程序報行業(yè)主管部門批準。

第三十五條項目承擔單位應當嚴格按照本辦法的規(guī)定，制定內部管理辦法，建立健全內部控制制度，加強對專項經費的監(jiān)督和管理，對專項經費及其自籌經費分別進行單獨核算。

第三十六條項目承擔單位應當嚴格按照本辦法規(guī)定的經費開支范圍和標準辦理支出。嚴禁使用項目經費支付各種罰款、捐款、贊助、投資等，嚴禁以任何方式變相謀取私利。

第三十七條項目承擔單位應當按照規(guī)定編制項目經費年度專項決算。項目經費下達之日起至年度終了不滿三個月的，當年可以不編報年度專項決算，其經費使用情況在下一年度的年度專項決算中反映。項目經費決算由項目承擔單位財務部門編制，于每年的4月20日前將上年度專項決算報送行業(yè)主管部門，行業(yè)主管部門審核匯總后于每年的5月20日前報送財政部。

第三十八條在研項目的年度結存經費，結轉下一年度按規(guī)定繼續(xù)使用。項目因故終止，項目承擔單位財務部門應當及時清理賬目與資產，編制財務報告及資產清單，按程序報送行業(yè)主管部門。行業(yè)主管部門組織進行清查處理，剩余經費（含處理已購物資、材料及儀器、設備的變價收入）收回行業(yè)主管部門，由行業(yè)主管部門按照財政部關于結余資金管理的有關規(guī)定執(zhí)行。

第三十九條專項經費形成的固定資產屬國有資產，一般由項目承擔單位進行管理和使用，國家有權調配用于相關科學研究開發(fā)。專項經費形成的知識產權等無形資產的管理，按照國家有關規(guī)定執(zhí)行。

專項實施中所需的儀器設備應當盡量采取共享方式取得。專項經費形成的大型科學儀器設備、科學數(shù)據、自然科技資源等，按照國家有關規(guī)定開放共享，減少重復浪費，提高資源利用效率。

項目承擔單位應當建立規(guī)范、健全的項目科學數(shù)據記錄和報告制度，按照行業(yè)主管部門的要求及時上報項目有關數(shù)據。