在各類型細胞表面HLA分子表達與否以及表達的密度，可以受不同的因素調節(jié)。一般認為，調控HLA分子表達的主要環(huán)節(jié)是轉錄速率。可能影響HLA分子表達的因素有：①組織細胞的分化階段：HLA分子是造血干細胞和某些免疫細胞的分化抗原，在細胞分化、成熟的不同階段，各類HLA抗原的表達可有改變。例如HLA-DQ分子是人單核細胞的成熟標記；Ⅱ類抗原僅表達在激活的T細胞表面。②某些疾病狀態(tài)：某些傳染性疾病、免疫性疾病、造血系統(tǒng)疾病以及腫瘤均可影響HLA抗原表達。如AIDS病患者單核細胞HLA-Ⅱ類抗原表達明顯減少，某些腫瘤細胞表面HLA-Ⅰ類抗原表達減少。③生物活性物質：某些細胞因子，例如三類干擾素（α、β、γ）以及TNFα、醫(yī)學|教育網搜集整理THFβ均可增強不同類型細胞HLA-Ⅰ類抗原表達；具有Ⅱ類抗原誘生能力的細胞因子包括IFNγ、TNFα、IL-6及GM-CSF等。此外，某些激素、某些神經遞質和神經肽也可影響HLA分子表達。

HLA分子在免疫應答與免疫調節(jié)中是一類關鍵的分子，故各種因素對HLA分子表達的調控可能是體內免疫調節(jié)網絡的重要組成部分。同時，受各種調節(jié)因子的影響，HLA分子的異常表達也參與某些疾病的發(fā)病機制。