在一些營養(yǎng)豐富的水體中，有些藍(lán)藻常于夏季大量繁殖，并在水面形成一層藍(lán)綠色而有腥臭味的浮沫，稱為“水華”，大規(guī)模的藍(lán)藻爆發(fā)，被稱為“綠潮”（和海洋發(fā)生的赤潮對應(yīng)）。綠潮引起水質(zhì)惡化醫(yī)|學(xué)教育網(wǎng)搜集整理，嚴(yán)重時耗盡水中氧氣而造成魚類的死亡。

在中國，太湖的藍(lán)藻爆發(fā)污染是藍(lán)藻危害的一個具體體現(xiàn)，最嚴(yán)重的危機出現(xiàn)在2007年。當(dāng)年6月，太湖藍(lán)藻大爆發(fā)，幾十厘米厚的藍(lán)藻覆蓋所有水面。據(jù)無錫市政府公布的統(tǒng)計數(shù)據(jù)，除無錫水廠外，其余占全市供水70%的水廠水質(zhì)都被污染，水龍頭里放出的水又黃又臭，200萬無錫市民生活飲用水受污染，市區(qū)純凈水被哄搶，政府雖及時采取措施，但已經(jīng)對人民的生活產(chǎn)生很大的影響。其后，盡管國家下了大力氣治理太湖污染，藍(lán)藻依然每年爆發(fā)。