屬于同源二聚體蛋白，分子量為56KDa。每個(gè)單體由449個(gè)氨基酸組成，完整的AKP分子呈現(xiàn)典型的α/β的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)，同時(shí)每個(gè)單體均具有一個(gè)活性中心，活性中心區(qū)域由Asp101-Ser102-Ala103三連體、Arg166、水分子、三個(gè)金屬離子及其配體氨基酸組成。AKP被phoA 基因編碼，與很多分泌蛋白一樣，在細(xì)胞質(zhì)內(nèi)合成氨基末端帶有信號(hào)肽的單體前體，信號(hào)肽引導(dǎo)前體跨內(nèi)膜運(yùn)輸后被切除，同源二聚體形成。

堿性磷酸酶是一種能夠?qū)?duì)應(yīng)底物去磷酸化的酶，即通過水解磷酸單酯將底物分子上的磷酸基團(tuán)除去，并生成磷酸根離子和自由的羥基，這類底物包括核酸、蛋白、生物堿等。而該脫去磷酸基團(tuán)的過程被稱為去磷酸化或脫磷酸化。堿性磷酸酶是磷酸酶的一種，磷酸酶的作用與激酶的作用正相反，激酶是磷酸化酶，可以利用能量分子，如ATP，將磷酸基團(tuán)加到對(duì)應(yīng)底物分子上。堿性磷酸酶在堿性環(huán)境有最大活力，對(duì)來源于細(xì)菌中的ALP來說，其最適pH是8.0，而對(duì)來源于牛的ALP則是8.5。

ALP是一種含鋅的糖蛋白，在堿性環(huán)境中（最適Ph為10左右）可以水解各種天然及人工合成的磷酸單酯化合物底物。