口腔執(zhí)業(yè)醫(yī)師——細菌的細菌的分類與命名法，由醫(yī)學(xué)教育網(wǎng)整如下：細菌的分類學(xué)（taxonomy）是一項復(fù)雜的工作，原則上分為種系分類和人工分類法兩種。

　　種系分類法（phylogenicclassification）：是根據(jù)細菌大分子（核酸、蛋白質(zhì)等）組成上的同源性程度分類。常用的方法有：（1）DNA序列測定；（2）DNA相關(guān)度測定；（3）核蛋白體16SRNA相關(guān)度測定。其中以（3）最為準確，因為細菌rRNA在進化過程中比較穩(wěn)定、保守，很少發(fā)生變異。

　　人工分類法（artificialclassification）：選擇一些較為穩(wěn)定的生物學(xué)性狀如細菌形態(tài)與結(jié)構(gòu)、染色性、生化反應(yīng)、抗原性等作為標記，測定不同細菌，分析各菌間的相關(guān)程度，將形狀相同或相近的細菌歸于一類，依次劃分菌種和菌屬。

　　細菌分類的層次與其他生物相同，即界、門、綱、目、科、屬、種。在細菌中，常用種和屬。

　　種（species）：是細菌分類的基本單位。生物學(xué)性狀基本相同的細菌群體構(gòu)成一個菌種。

　　屬（genus）：性狀相近，關(guān)系密切的若干菌種組成一個菌屬。

　　亞種與型（subspeciesandtype）：同一菌種中的各個細菌，雖然性狀基本相同，但在某些方面仍有一定差異。差異較明顯地稱亞種，差異小的則為型。如按抗原結(jié)構(gòu)不同而分為不同的血清型，按生化反應(yīng)和其他生物學(xué)性狀不同而分為不同的生物型（biotype）等。

　　株（strain）：來自不同來源的同一菌種的細菌稱為該菌的不同菌株，如從不同的肺結(jié)核患者痰液中分離出10種結(jié)核桿菌，即為10株結(jié)核桿菌。同一菌種的不同菌株，性狀可以完全相同，也可有某些差異。具有某種細菌典型特征的菌株稱為該菌的標準菌株（standardstrain）。

　　命名法細菌的命名采用拉丁雙名法，每個菌名由兩個拉丁字組成。前一字為屬名，用名詞，大寫；后一字為種名，用形容詞，小寫。一般署名表示細菌的形態(tài)或?qū)毦陌l(fā)現(xiàn)有貢獻者，種名表明細菌的某些性狀特征、寄居部位或所致疾病等。例如Staphylococcusaureus，金黃色葡萄球菌。屬名常不將全文寫出，只用第一個字母大寫代表，如M.tuberculosis，等。有時泛指某一屬細菌，不特指其中某個菌種，則可在屬名后加sp.，如Salmonellasp.表示為沙門菌屬中的細菌。