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生殖器皰疹的傳染源是患者及亞臨床無癥狀的帶病毒者，尤其是在患者的生殖器皮膚或粘膜的皰疹內含有單純皰疹病毒，可通過性接觸而傳染給配偶或其他性侶，也可在同性戀者中互相傳染。
有時在口腔或口腔周圍患有皰疹的人，可通過口腔-生殖器性交，使對方傳染生殖器皰疹。因此，不同方式的異性性行為，也可傳播生殖器皰疹病。
由于有感染性的病毒能在潮濕的環(huán)境中存活數小時，因而單純皰疹也可通過污染物而間接傳播。
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