目前我國天然藥物化學(xué)研究依其目的不同可分為3個方面：

　?、僖躁U明藥用生物有效成分，獲得具有新結(jié)構(gòu)的化合物或具有生物活性的單體為目的，進(jìn)行提取分離條件、結(jié)構(gòu)鑒定、一般活性研究；

　?、谝越鉀Q自然資源有限的活性化合物或其前體的來源為目的，進(jìn)行半合成及生物轉(zhuǎn)化研究；

　?、垡垣@得高效低毒的創(chuàng)新藥為目的，以天然活性化合物為先導(dǎo)物，合成一系列結(jié)構(gòu)類似物進(jìn)行構(gòu)效關(guān)系研究。由此可見，天然藥物研究已經(jīng)從最初對天然來源活性化合物被動全盤地接受到積極主動地改進(jìn)，研究在不斷深入。

　　1 天然藥物化學(xué)研究應(yīng)以創(chuàng)制新藥為目標(biāo) 知識產(chǎn)權(quán)的保護(hù)和市場競爭的形勢迫使我國必須將創(chuàng)新藥物研究放在重要位置。新藥研究周期長，風(fēng)險大，投入高，而我國天然藥物資源豐富、經(jīng)濟(jì)基礎(chǔ)相對比較薄弱，從天然產(chǎn)物中尋找創(chuàng)新藥物適合現(xiàn)階段國情。

　　國內(nèi)外研究經(jīng)驗表明，來自于天然的先導(dǎo)化合物很有希望成為治療疑難病癥的新藥，而且天然產(chǎn)物藥理篩選的覆蓋率比合成化合物高。天然先導(dǎo)化合物的發(fā)現(xiàn)為新藥的目標(biāo)化合物提供了結(jié)構(gòu)模式，從天然結(jié)構(gòu)活性成分出發(fā)，經(jīng)結(jié)構(gòu)修飾、類似物的合成及系統(tǒng)的活性研究，總結(jié)結(jié)構(gòu)與活性（毒性）的相關(guān)性，作為設(shè)計新藥目標(biāo)化合物的基礎(chǔ)，是國際上研究天然活性成分的主要思路和方法。

　　我國在該領(lǐng)域的研究中，上述第一個方面的研究比較普遍，以發(fā)表論文為其主要研究成果；國家自然科學(xué)基金以資助創(chuàng)新藥物的基礎(chǔ)研究為主，以尋找天然先導(dǎo)化合物繼而獲得專利保護(hù)的新藥為目的和主要成果。在現(xiàn)階段，這3個方面的研究還會長期并存，而創(chuàng)新藥物的研究，應(yīng)在得到活性單體的基礎(chǔ)上進(jìn)行深入的構(gòu)效關(guān)系研究。

　　天然來源的新藥創(chuàng)制在我國有較好的基礎(chǔ)和潛力。天然藥物化學(xué)基礎(chǔ)研究應(yīng)從目前我國新藥研究的迫切需要出發(fā)，從我國社會和經(jīng)濟(jì)發(fā)展的長遠(yuǎn)利益考慮，為我國創(chuàng)制新藥發(fā)揮重要作用，促進(jìn)創(chuàng)新藥物的發(fā)展，而不應(yīng)僅僅停留在分離純化、結(jié)構(gòu)鑒定、活性測定、發(fā)表論文為止。

　　2 加強(qiáng)基礎(chǔ)研究是創(chuàng)制新藥的關(guān)鍵 創(chuàng)制新藥，基礎(chǔ)研究是關(guān)鍵。如果沒有長期深入、扎實和雄厚的基礎(chǔ)研究工作積累，就不會有創(chuàng)新藥物的發(fā)展，新藥的來源也很快就會枯竭。我國新藥研究與國際先進(jìn)水平仍有很大差距。多年來創(chuàng)制的新藥品種少，有特色的藥物更少。其根本原因是基礎(chǔ)研究薄弱，不能滿足創(chuàng)新藥發(fā)展的需要。

　　新藥研究艱難，短期內(nèi)難以取得明顯成效，因此一部分科研人員不愿從事探索性強(qiáng)、需要長期進(jìn)行的基礎(chǔ)研究，而選擇一些短線課題和開發(fā)研究項目。很多天然藥物化學(xué)研究停留在新結(jié)構(gòu)化合物的發(fā)現(xiàn)、跟蹤性研究或缺乏創(chuàng)新的開發(fā)階段。雖然研究“短、平、快”和“me too”類新藥可解燃眉之需，但從長遠(yuǎn)考慮，加強(qiáng)基礎(chǔ)研究、儲備技術(shù)和人才、發(fā)展具有我國自主知識產(chǎn)權(quán)的新藥才是根本目標(biāo)。

　　天然藥物化學(xué)研究的深入應(yīng)以定量構(gòu)效關(guān)系和三維構(gòu)效關(guān)系理論為指導(dǎo)，在先導(dǎo)化合物分子結(jié)構(gòu)的優(yōu)化方面下工夫，即根據(jù)疾病的病因、發(fā)病機(jī)制、細(xì)胞生物學(xué)特點(diǎn)、受體的結(jié)構(gòu)等尋找活性尤其是有特殊作用機(jī)制的先導(dǎo)化合物，利用適當(dāng)?shù)乃幚砟Ｐ脱芯糠肿拥幕钚院投拘宰饔脵C(jī)制，在此基礎(chǔ)上進(jìn)行分子的結(jié)構(gòu)改造，研究分析不同活性的分子其結(jié)構(gòu)和構(gòu)象的差異，總結(jié)其活性所必需的結(jié)構(gòu)及其與某種藥理（毒理）作用之間的規(guī)律，據(jù)此進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化，為設(shè)計合成高效低毒的新藥奠定基礎(chǔ)。在此過程中，不僅要充分應(yīng)用還要不斷地總結(jié)和發(fā)展構(gòu)效關(guān)系的理論。

　　基礎(chǔ)科學(xué)研究的根本在于創(chuàng)新，科學(xué)研究的積累可以開拓創(chuàng)新的思路。目前我國天然藥物化學(xué)研究的思路大多是跟蹤國際熱點(diǎn)，缺乏原始的創(chuàng)新思路，探索性不強(qiáng)。如紫杉醇、三尖杉酯堿、長春新堿等抗癌藥物，都是在國外有一定研究基礎(chǔ)后移植過來的，我國自行發(fā)現(xiàn)的類似這樣療效好、作用機(jī)制明確、得到國際公認(rèn)的新藥極少。往往是有個好的苗頭化合物大家便紛紛一涌而上，將許多人力、物力集中在某個熱點(diǎn)的跟蹤研究上，不利于該領(lǐng)域的發(fā)展，也難以發(fā)展成為具有我國專利的創(chuàng)新藥物。

　　3 應(yīng)用多學(xué)科的理論和技術(shù)，促進(jìn)天然藥物化學(xué)研究的深入 新藥研究是多學(xué)科合作的系統(tǒng)工程。而天然藥物化學(xué)與藥物分析、藥物化學(xué)、生藥學(xué)、分子生物學(xué)、生物工程、微生物學(xué)、藥理學(xué)、毒理學(xué)均有密切的關(guān)系，其發(fā)展必須充分利用相關(guān)學(xué)科的理論、方法與技術(shù)進(jìn)行綜合研究。

　　在成分分離方面，各種現(xiàn)代新技術(shù)的應(yīng)用，不僅使非極性的、小分子的化合物分離速度和分離質(zhì)量有了大幅度提高，而且使那些長期以來分離純化難度較大苷類等的水溶性化合物也得到較好的分離。結(jié)構(gòu)鑒定方面，UV，IR，MS，NMR（包括近年發(fā)展起來的質(zhì)譜、核磁共振各種新技術(shù)），X-射線晶體衍射及SDS-PAGE技術(shù)等的應(yīng)用，為結(jié)構(gòu)和純度鑒定提供了有力的技術(shù)手段。

　　利用細(xì)胞和組織培養(yǎng)技術(shù)將植物的分生組織進(jìn)行離體培養(yǎng)和植物的無性繁殖，從生物反應(yīng)器中培養(yǎng)植物生產(chǎn)某類化合物；利用代謝產(chǎn)物的發(fā)酵和轉(zhuǎn)化器官的擴(kuò)增研究生產(chǎn)活性成分；利用基因工程研究找出形成植物活性成分的“關(guān)鍵酶”，再選擇合適的載體、受體的適當(dāng)部位和適當(dāng)發(fā)育時期予以表達(dá)以提高某類成分含量；利用轉(zhuǎn)基因生物（如轉(zhuǎn)基因大腸桿菌、酵母菌等）作為反應(yīng)器以生產(chǎn)外源基因編碼的產(chǎn)物；利用生物轉(zhuǎn)化技術(shù)對一些天然先導(dǎo)化合物的結(jié)構(gòu)進(jìn)行修飾，得到不依賴自然資源的目標(biāo)或前體化合物。

　　天然活性產(chǎn)物構(gòu)效關(guān)系的研究需要藥理學(xué)和毒理學(xué)的配合，以了解化合物的活性、毒性及作用機(jī)制，為活性分子的設(shè)計提供依據(jù)。在活性分子的設(shè)計方面，利用分子圖形學(xué)及各種軟件包、圖形工作站系統(tǒng)等尋找分子活性部位、優(yōu)化結(jié)構(gòu)、優(yōu)勢構(gòu)象、活性強(qiáng)弱不同的化合物間立體結(jié)構(gòu)的同一性與差異及活性結(jié)構(gòu)的拓?fù)涮匦浴⑺幮Щ鶊F(tuán)和活性規(guī)律；利用計算機(jī)輔助設(shè)計高活性分子，研究分子的三維結(jié)構(gòu)和活性的關(guān)系，并提出相應(yīng)的活性分子的結(jié)構(gòu)模型，使得結(jié)構(gòu)改造、化合物的合成更具有方向性。

　　4 天然藥物化學(xué)研究應(yīng)注意的問題

　　4.1 目前有相當(dāng)一部分研究工作未進(jìn)行藥理學(xué)、毒理學(xué)和構(gòu)效關(guān)系研究，有可能使一些苗頭化合物不能成為先導(dǎo)化合物，非?？上?。條件有限和經(jīng)費(fèi)不足是重要原因。應(yīng)提倡跨學(xué)科、多部門合作。

　　4.2 注意傳統(tǒng)中藥用藥經(jīng)驗優(yōu)勢和資源優(yōu)勢相結(jié)合。我國有豐富的物種，其中高等植物30 000種以上，還有低等植物、真菌、放線菌，大部分資源有待于研究利用，這些優(yōu)勢也是許多國外學(xué)者積極尋求與我們合作的重要原因。目前選用的研究對象大多為我國傳統(tǒng)中藥，但還應(yīng)擴(kuò)大篩選研究范圍。我國有豐富的天然生物資源及民間、民族用藥，還有一些生物長期處于自生自滅狀態(tài)而未得以研究利用，其中一些物種還未進(jìn)行過化學(xué)研究，它們也應(yīng)能成為創(chuàng)制新藥的來源。

　　4.3 我國利用海洋藥物有悠久的歷史，目前已有700多個中成藥組方中有海洋生物。目前我國對海洋生物研究強(qiáng)調(diào)開發(fā)利用多，重視基礎(chǔ)研究工作不夠，總體水平較低。這種狀況亟待改變。海洋生物中已發(fā)現(xiàn)有多肽類、大環(huán)聚酯類、萜類、聚醚類等2 000多種生物活性物質(zhì)，從中發(fā)現(xiàn)了一批重要的抗癌、抗病毒活性物質(zhì)，顯示出海洋藥物研究利用具有十分廣闊的前景，是創(chuàng)新藥物的又一豐富來源。

　　4.4 應(yīng)注意結(jié)構(gòu)新穎的、小分子活性化合物的研究。天然活性化合物由于來源問題和本身存在的副作用問題而很難直接成為藥物，需要以其為先導(dǎo)化合物進(jìn)行修飾乃至全合成。因而小分子化合物在快速成藥方面具有明顯的優(yōu)勢。

　　4.5 應(yīng)重視篩選研究具有新的、特殊作用機(jī)制的先導(dǎo)化合物。不局限于針對某一藥理作用尋找新結(jié)構(gòu)的化合物，還應(yīng)關(guān)注遺傳學(xué)、生理學(xué)、細(xì)胞學(xué)尤其是藥理學(xué)等相關(guān)學(xué)科的新發(fā)現(xiàn)、新的受體結(jié)構(gòu)的發(fā)現(xiàn)以及疾病病因、發(fā)病機(jī)制等研究中的新進(jìn)展，尋找有新的作用機(jī)制的化合物。如我國目前天然藥物研究中涉及較多的抗癌藥物研究，其篩選大多以細(xì)胞毒性為指標(biāo)，針對其它特殊作用機(jī)制的化合物研究不多。今后應(yīng)特別注意尋找有防止腫瘤轉(zhuǎn)移、抗多藥耐藥和免疫抑制作用及作用于其它新靶點(diǎn)的先導(dǎo)化合物。

　　4.6 有些研究人員在發(fā)現(xiàn)了有苗頭的新化合物后，立即發(fā)表論文，致使自己的發(fā)現(xiàn)因為已經(jīng)公布而不能申請專利，還有些發(fā)現(xiàn)僅申請了中國專利，錯過了申請國外專利的時機(jī)，無法使發(fā)明得到應(yīng)有的、最大范圍的保護(hù)，影響了研究成果的轉(zhuǎn)化。這對個人和國家都是重大的損失。因此，科研人員應(yīng)了解國內(nèi)外有關(guān)專利和知識產(chǎn)權(quán)保護(hù)方面的知識，注意保護(hù)自己多年的研究成果。