國家經貿委醫(yī)藥司的主要職能是：貫徹、執(zhí)行國家有關法律、法規(guī)，對所轄行業(yè)、企業(yè)生產經營方面進行經濟管理，對醫(yī)藥行業(yè)經濟運行進行宏觀調控。根據國家產業(yè)政策，制定醫(yī)藥行業(yè)發(fā)展戰(zhàn)略、長遠規(guī)劃，制定行業(yè)或企業(yè)的產品升級換代規(guī)劃、計劃；指醫(yī)`學教育網搜集整理導企業(yè)按國家或市場需求調整產品結構，推進技術進步，提高企業(yè)產品在國內外市場中的競爭能力；負責醫(yī)藥行業(yè)的統(tǒng)計、信息工作；負責藥品、藥械儲備及災情、疫情、軍需、戰(zhàn)備藥品及藥械的緊急調度工作；組織實施中藥，生化制藥的行業(yè)管理。