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DNA克隆(DNA cloning) :就是應(yīng)用酶學(xué)的方法,在體外把目的基因與載體DNA結(jié)合成具有自我復(fù)制能力的DNA分子一一復(fù)制子(replicon),繼而通過(guò)轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)染宿主細(xì)胞、篩選出含有目的基因的轉(zhuǎn)化子細(xì)胞,再進(jìn)行擴(kuò)增、提取獲得大量同一DNA分子,即DNA克隆。由于早期研究是從較大的染色體分離、擴(kuò)增特異性基因,因此DNA克隆又稱(chēng)基因克隆(gene cloning )。
基因組DNA文庫(kù):分離組織或細(xì)胞染色體DNA,利用限制性內(nèi)切核酸酶將染色體DNA切割成基因水平的許多片段,其中即含有我們感興趣的基因片段。將它們與適當(dāng)?shù)目寺≥d體拼接成重組DNA分子,繼而轉(zhuǎn)入受體菌擴(kuò)增,使每個(gè)細(xì)菌內(nèi)都攜帶一種重組DNA分子的多個(gè)拷貝。不同細(xì)菌所包含的重組DNA分子內(nèi)可能存在不同的染色體DNA片段,這樣生長(zhǎng)的全部細(xì)菌所攜帶的各種染色體片段就代表了整個(gè)基因組。存在于轉(zhuǎn)化細(xì)菌內(nèi)、由克隆載體所攜帶的所有基因組DNA的集合稱(chēng)基因組DNA文庫(kù)(genome DNA library)。
cDNA文庫(kù):以mRNA為模板,利用反轉(zhuǎn)錄酶合成與mRNA互補(bǔ)的DNA (cDNA ),再?gòu)?fù)制成雙鏈cDNA片段,與適當(dāng)載體連接后轉(zhuǎn)入受體菌,即獲得cDNA文庫(kù)(cDNA library)。與基因組DNA文庫(kù)類(lèi)似,由總mRNA制作的cDNA文庫(kù)包含了細(xì)胞表達(dá)的各種mRNA信息,自然也含有我們感興趣的編碼cDNA。當(dāng)前發(fā)現(xiàn)的大多數(shù)蛋白質(zhì)的編碼基因幾乎都是這樣分離的。
限制性內(nèi)切核酸酶(restriction endonuclease): 是能夠識(shí)別DNA的特異序列,并在識(shí)別位點(diǎn)或其周?chē)懈铍p鏈DNA的一類(lèi)內(nèi)切酶。限制性內(nèi)切核酸酶識(shí)別DNA的結(jié)構(gòu)順序?yàn)榛匚慕Y(jié)構(gòu)。限制性內(nèi)切核酸酶存在于細(xì)菌體內(nèi),限制外源DNA、保護(hù)自身DNA,對(duì)細(xì)菌遺傳性狀的穩(wěn)定遺傳具有重要意義。
α互補(bǔ)(alpha complementation):經(jīng)改造的M13載體有M13mp系列及pUC系列。它們是在M13基因間隔區(qū)插入E.coli的一段調(diào)節(jié)基因及l(fā)acZ的N端146個(gè)氨基酸殘基編碼基因,其編碼產(chǎn)物即為β半乳糖苷酶的α片段。突變型lac-E.coli可表達(dá)該酶的ω片段(酶的C端)。單獨(dú)存在的α及ω片段均無(wú)β半乳糖苷酶活性,只有宿主細(xì)胞與克隆載體同時(shí)共表達(dá)兩個(gè)片段時(shí),宿主細(xì)胞內(nèi)才有β半乳糖苷酶活性,使特異性作用物變?yōu)樗{(lán)色化合物,這就是所謂的α互補(bǔ)(alpha complementation)。由M13改造的載體含不同位置的克隆位點(diǎn),可接受不同限制性內(nèi)切酶的酶切片段。如果插人的外源基因是在lacZ基因內(nèi),則會(huì)干擾lacZ的表達(dá),利用lac- E.coli轉(zhuǎn)染或感染細(xì)胞,在含X-gal的培養(yǎng)基上生長(zhǎng)時(shí)會(huì)出現(xiàn)白色菌落;如果在lacZ基因內(nèi)無(wú)外源基因插人,則有l(wèi)ac Z表達(dá),轉(zhuǎn)化菌在同樣條件下呈藍(lán)色菌落(圖15-8)。再結(jié)合插入片段的序列測(cè)定可篩選、鑒定重組體與非重組體載體。
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