（一）無菌性腦膜炎  主要應與其他病毒引起的腦膜腦炎相鑒別：

　　1、流行性腮腺炎伴腦膜腦炎  多流行于冬春，常伴腮腺腫大，血清淀粉酶可增高，但柯薩奇病毒B3、埃可病毒9、16型也可引起腮腺腫大，則不易鑒別。

　　2、脊髓灰質(zhì)炎病毒引起的腦膜腦炎  如伴有癱瘓較易診斷，因柯薩奇病毒和埃可病毒感染很少發(fā)生癱瘓，且多為輕癥，大多不留后遺癥。

　　3、乙型腦炎多集中發(fā)生在夏秋季節(jié)，起病急，多伴神智改變，周圍血及腦脊液中白細胞增多明顯，中性粒細胞百分率高為其特點。

　　4、流行性腦脊髓膜炎及其他化膿性腦膜炎  輕癥或未經(jīng)徹底治療者尤需加以鑒別。起病急，腦膜刺激征明顯，腦脊液檢查一般以中性粒細胞為多，糖和氯化物降低，如能在腦脊液中找到致病菌即可確診。醫(yī)`學教育網(wǎng)搜集整理血象白細胞總數(shù)及中性粒細胞均增多。

　　5、結(jié)核性腦膜炎  起病緩慢，有其他結(jié)核病灶及結(jié)核接觸史，腦脊液糖和氯化物降低，有薄膜形成，可找到結(jié)核桿菌，結(jié)核菌素皮膚試驗陽性。

　　6、隱球菌腦膜炎  多起病緩慢，病程反復遷延，易有后遺癥。

　　7、嬰兒腦型腳氣?。ňS生素B₁缺乏癥）以及其他原因引起的腦病（如中毒性腦炎）  均應注意勿與腸道病毒性腦炎相混淆。詳細病史及仔細體查至為重要。

　　腸道病毒引起的無菌性腦膜炎雖不易與其他病毒所致者進行臨床鑒別，但如發(fā)生在夏秋季節(jié)、有流行趨勢、伴發(fā)皮疹、肌痛、口、咽部皰疹、心肌炎等腸道病毒常見癥候群時，則頗有助于診斷。

　　（二）流行性肌痛  胸痛顯著時應與胸膜炎、心絞痛、心肌梗死等鑒別，胸透及心電圖檢查有助于診斷。腹部疼痛嚴重時酷似闌尾炎，在成人尚需除外膽囊炎、膽石癥、胃潰瘍穿孔、急性胰腺炎等。肌痛一般局限于淺表部位，無深部壓痛或反跳痛。此外，腹部炎癥常伴周圍血白細胞計數(shù)和中性粒細胞增加，而本癥正常。急性胰腺炎時，血清淀粉酶可增高。

　　（三）急性心肌炎、心包炎  新生兒心肌炎常與其他急性感染、敗血癥、肺炎等不易鑒別，如迅速出現(xiàn)心功能衰竭癥狀或心律失常，應疑及腸道病毒感染。伴有皮疹、血清轉(zhuǎn)氨酶升高以及腦脊液改變者，更有助于診斷。年長兒及青年期發(fā)生心肌炎、心包炎者，應首先除外風濕癥，后者常有關節(jié)炎癥狀，抗鏈球菌溶血素"O"試驗、粘蛋白及C反應性蛋白增高有助鑒別。中年以上發(fā)生心肌炎需與冠心病相鑒別。

　　（四）皰疹性咽峽炎，手足口病  需與單純皰疹引起的口腔炎鑒別。皰疹性咽峽炎常發(fā)生流行，其口腔皰疹常限于口腔后部。手、足、口病常在小范圍內(nèi)傳播形成局部流行，其口腔前部皰疹易形成潰瘍，并伴發(fā)手、足較小較硬的皮疹。單純皰疹口腔炎多為散發(fā)病例，病變可在口腔任何部位發(fā)生，但以皮膚粘膜交界處為多見。

　　（五）出疹性疾病  多形性皮疹中斑丘疹需與麻疹、風疹相鑒別。一般很少伴耳后、枕后淋巴結(jié)腫，疹退后也無色素沉著或脫屑。埃可16型感染皮疹在熱退后出現(xiàn)，應與嬰兒急疹鑒別。猩紅熱樣皮疹需與猩紅熱相區(qū)別，醫(yī)`學教育網(wǎng)搜集整理一般癥狀及咽部炎癥均較猩紅熱為輕。出現(xiàn)皰疹者應與水痘鑒別，如手、足、口病的皮疹形態(tài)較水痘為小，皮厚且較硬，多分布于手、足，少見于軀干。