組織器官的病理損害和功能障礙僅限于抗體或致敏淋巴細胞所針對的某一器官。主要有慢性淋巴性甲狀腺炎、甲狀腺功能亢進、胰島素依賴型糖尿病、重癥肌無力、慢性潰瘍性結腸炎、醫(yī)學|教育網搜集惡性貧血伴慢性萎縮性胃炎、肺出血腎炎綜合征（goodpasturesyndrome）、尋常天皰瘡、類天皰瘡、原發(fā)性膽汁性肝硬變、多發(fā)性腦脊髓硬化癥、急性特發(fā)性多神經炎等，其中常見者將分別于各系統(tǒng)疾病中敘述。

　?。ǘ┫到y(tǒng)性自身免疫病：

　　由于抗原抗體復合物廣泛沉積于血管壁等原因導致全身多器官損害，稱系統(tǒng)性自身疫病。習慣上又稱之為膠原病或結締組織病，醫(yī)學|教育網搜集這是由于免疫損傷導致血管壁及間質的纖維素樣壞死性炎及隨后產生多器官的膠原纖維增生所致。事實上無論從超微結構及生化代謝看，膠原纖維大多并無原發(fā)性改變。

　　常見的自體（自身）免疫病有：類風濕、紅斑狼瘡、干燥綜合征、類風濕性關節(jié)炎、硬皮病、皮肌炎、多肌炎（多發(fā)性肌炎）、結節(jié)性多動脈炎、成人斯帝爾（still）、嗜酸性筋膜炎、白塞氏?。ò兹暇C合癥）、脂膜炎、紅皮病、肺間質纖維化、Wegener肉芽腫病等等。