藍細菌（Cyanobacteria）原名藍藻或藍綠藻，是一類進化歷史悠久、革蘭氏染色陰性、無鞭毛、含葉綠素a（但不形成葉綠體）、能進行產(chǎn)氧性光合作用的大型原核微生物。藍細菌是古老的生物，在50億年前，地球本是無氧的環(huán)境，使地球由無氧環(huán)境轉(zhuǎn)化為有氧環(huán)境是由于藍細菌出現(xiàn)并產(chǎn)氧所致。藍細菌是海洋生態(tài)系統(tǒng)的重要組成部分和海洋初級生產(chǎn)力的重要組成部分。藍細菌在植物學和藻類學中被分類為藍藻門。由于它的細胞結(jié)構(gòu)簡單，只具有原始核，沒有核膜和核仁，只有染色質(zhì)，只具有葉綠素，沒有葉綠體。故將它列為原核生物界的藍光合菌門，這一門的細菌叫藍細菌。

藍細菌分布極廣，普遍生長在淡水、海水和土壤中，并且在極端環(huán)境（如溫泉、鹽湖、貧瘠的土壤、巖石表面或風化殼中以及植物樹干等）中也能生長，故有“先鋒生物”的美稱。許多藍細菌類群具有固氮能力，它們已經(jīng)被證實：可以通過氮氣的固定來提高稻田和其他土壤的肥力方面有重要作用。一些藍細菌還能與真菌、苔蕨類、蘇鐵科植物、珊瑚甚至一些無脊椎動物共生醫(yī)學|教育網(wǎng)搜集整理。

藍細菌在污水處理，水體自凈中起積極作用。在氮、磷豐富的水體中生長旺盛，可作為水體富營養(yǎng)化的指示生物。有某些屬種在富營養(yǎng)化的海灣和湖泊中引起海灣的赤潮和湖泊的水華。嚴重者引起水生動物大量死亡。