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表達(dá)譜差異分析:
表達(dá)譜差異分析主要包括基因表達(dá)譜和蛋白質(zhì)表達(dá)譜。大規(guī)模表達(dá)譜分析已經(jīng)成為認(rèn)識(shí)疾病分子機(jī)制的有利方法,在癌癥研究等方面取得了一定的進(jìn)展。成功的表達(dá)譜分析基于實(shí)驗(yàn)及其過程分析的有機(jī)結(jié)合。實(shí)驗(yàn)過程從關(guān)注的疾病開始,首先收集大量的疾病相關(guān)組織樣本,樣本數(shù)量可從10多個(gè)到數(shù)百個(gè),但必須足以對(duì)每一組織類型及個(gè)體差異進(jìn)行比較分析,而且許多情況下不能僅簡(jiǎn)單地分為正常和疾病組織。例如,在對(duì)糖尿病的研究中,所收集的樣本來自健康人、胰島素耐受和糖尿病病人的不同試驗(yàn)階段,如胰島素治療前后。樣品還應(yīng)包括其他器官的取材,以便進(jìn)行基因表達(dá)的組織分布研究。為了便于對(duì)后來的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析管理,需采集并儲(chǔ)存所有的組織樣本和臨床參數(shù)。接下來進(jìn)行組織樣本的處理,利用生物芯片(寡核苷酸芯片、cDNA芯片或全基因組芯片)進(jìn)行表達(dá)譜測(cè)定,并進(jìn)行生物信息學(xué)分析。
通常,表達(dá)譜的分析結(jié)果需進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)加以證實(shí)。定量RT2PCR是最靈敏的確證方法,該方法還可以將確證實(shí)驗(yàn)的范圍擴(kuò)大到原測(cè)組織以外的更廣泛的組織和組織類型,揭示基因表達(dá)的組織分布情況醫(yī)`學(xué)教育網(wǎng)搜集整理。
確證實(shí)驗(yàn)揭示了疾病相關(guān)基因。據(jù)此,可以進(jìn)行進(jìn)一步研究,探索這些基因的功能,開發(fā)新的治療手段。例如,對(duì)于正常和疾病組織中表達(dá)有顯著性變化的基因,可以進(jìn)行新治療靶點(diǎn)的鑒定和確定研究,或利用實(shí)驗(yàn)和分析工具研究分析其功能;對(duì)于疾病組織中活性升高的酶,可以當(dāng)作前藥活化酶進(jìn)行鑒定研究。典型的表達(dá)譜能夠顯示疾病過程中有大量的已知基因表達(dá)的改變,而許多已知基因的代謝通路、表達(dá)產(chǎn)物酶學(xué)分類和蛋白質(zhì)功能業(yè)已發(fā)表,將兩者對(duì)照分析,可以鑒定出酶活性,選擇其中可能成為前藥活化酶的部分進(jìn)行進(jìn)一步研究;對(duì)于疾病特異的蛋白質(zhì),可以進(jìn)行抗原表型分析,決定疫苗的開發(fā)策略。
尋找差異表達(dá)基因的方法除芯片技術(shù)外,一些新的檢測(cè)方法如差異顯示PCR、消減雜交,等也相繼得到結(jié)合應(yīng)用。
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