西藥的副作用較大，該藥罕有肝功能損害。 致畸胎危險。

神經(jīng)功能紊亂：在丙戊酸鈉治療期間，少數(shù)患者出現(xiàn)嗜睡或木僵，并導(dǎo)致一過性昏迷（腦病），當(dāng)治療時，可單獨出現(xiàn)或與癲癇發(fā)作同時出現(xiàn)，當(dāng)劑量減少停用時，這些癥狀會減少，這些病例常發(fā)現(xiàn)在聯(lián)合治療特別是用苯巴比妥或突然增加丙戊酸劑量之后。 消化道紊亂（惡心、胃痛）多出現(xiàn)在治療開始時，但是不需停止治療，癥狀通?？稍跀?shù)天內(nèi)消失。 短暫的和/或與劑量相關(guān)的不良反應(yīng)已有報導(dǎo)：脫發(fā)，輕度姿勢性震顫和嗜睡。 已有報導(dǎo)單純纖維蛋白原減少或出血時間延長，通常不伴有臨床體征，此多發(fā)生于大劑量時（丙戊酸鈉對血小板聚集第二期有抑制作用）。

血液系統(tǒng)：多為血小板減少，罕有貧血，白細(xì)胞減少或全血細(xì)胞減少。 偶有報導(dǎo)胰腺炎，有時導(dǎo)致死亡。 有報告血管炎。

無肝功能異常的單純和輕度高氨血癥時有出現(xiàn)，但不需要停止治療。 也報告體重增加，閉經(jīng)及月經(jīng)紊亂。 偶有報導(dǎo)可逆或不可逆的聽力喪失，但其因果關(guān)系尚未明確。 丙戊酸可引起皮膚反應(yīng)，如皮疹，在某些病例有毒性上皮壞死溶解，Stevens-Johnson綜合征，多形性紅斑了有報導(dǎo)。 有單獨報導(dǎo)，伴隨丙戊酸治療出現(xiàn)可逆性Fanconi氏綜合征，但其作用機理未明。