在生產(chǎn)上常見(jiàn)的雜菌，感染段木的主要有棉腐菌、裂褶菌、云芝、木霉等；為害子實(shí)體的，主要有青霉、木霉、織殼霉（俗稱(chēng)白粉?。?、紅酵母等。其中以織殼霉最常見(jiàn)，為害最嚴(yán)重，發(fā)病的耳片形成一層粉狀物，并使子實(shí)銀耳體僵化。防治上以 抓好栽培場(chǎng)所的清潔衛(wèi)生和通風(fēng)換氣為主，防止或減少病害發(fā)生。對(duì)發(fā)病嚴(yán)重的子實(shí)體應(yīng)及時(shí)摘除，然后再?lài)娛蚝蟿┻M(jìn)行控制。耳木污染其他雜菌對(duì)應(yīng)及時(shí)刮除刷洗，然后用石灰水消毒，置陽(yáng)光下曬1～2天再恢復(fù)管理。

常見(jiàn)的害蟲(chóng)有線(xiàn)蟲(chóng)、螨類(lèi)、菌蠅、蛞蝓等，其中線(xiàn)蟲(chóng)是引起爛耳的主要蟲(chóng)害，侵害耳基使耳片得不到營(yíng)養(yǎng)而腐爛。在預(yù)防上，用水要干凈，防止水中帶有線(xiàn)蟲(chóng)，段木勿沾泥土，防止線(xiàn)蟲(chóng)入侵。對(duì)已發(fā)生的爛耳，應(yīng)及時(shí)刮除，并用清水刷洗，防止蔓延。藥物防治可用1%醋酸或稀釋4倍的醋，或0.1%～0.2%敵百蟲(chóng)噴射耳木，可以抑制線(xiàn)蟲(chóng)的繁殖。螨類(lèi)也是銀耳的主要蟲(chóng)害。繁殖極快，常蛀食菌絲和耳根，發(fā)生后，應(yīng)用0.5%的敵敵畏噴灑耳場(chǎng)并用1：800倍的20%可濕性殺螨砜浸濕耳木（浸后立即取出）或噴濕耳木進(jìn)行防治。也可用800倍的樂(lè)果或敵百蟲(chóng)噴殺。