乙腦病毒特異性IgM抗體陽性的意義主要在于它能作為早期診斷日本腦炎（簡稱“乙腦”）的重要依據(jù)。當人體感染乙腦病毒后，免疫系統(tǒng)會產(chǎn)生針對該病毒的特異性抗體，其中最早出現(xiàn)的是IgM型抗體。因此，在患者發(fā)病初期進行血清學檢測時，如果發(fā)現(xiàn)乙腦病毒特異性IgM抗體陽性，通常提示近期有乙腦病毒感染的可能性較大。

需要注意的是，雖然乙腦病毒特異性IgM抗體陽性對診斷乙腦具有較高的參考價值，但也不能單獨作為確診依據(jù)。在臨床實踐中，醫(yī)生還需要結合患者的流行病學史（如是否處于乙腦高發(fā)季節(jié)、是否有蚊蟲叮咬史等）、臨床表現(xiàn)以及其他實驗室檢查結果綜合判斷。此外，在某些情況下，如患者曾經(jīng)接種過乙腦疫苗或既往感染過乙腦病毒，也可能出現(xiàn)IgM抗體陽性的情況，因此需要進一步的鑒別診斷。