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東南大學醫(yī)學院坐落在歷史文化名城南京市風光秀麗的玄武湖畔，原國立中央大學醫(yī)學院的舊址內。學院前身為1935年的中央大學醫(yī)學院，定址于南京市鼓樓區(qū)丁家橋。1937年抗日戰(zhàn)爭爆發(fā)后醫(yī)學院遷至四川成都，與華西大學、齊魯大學合作教學，并于1939年設立牙科醫(yī)院，時任院長為內科學教授戚壽南。1946年中央大學在南京復校上課，醫(yī)學院仍設在丁家橋。新中國成立后中央大學改名為南京大學，醫(yī)學院也相應改名為南京大學醫(yī)學院，設基礎醫(yī)學部、治療醫(yī)學部和社會醫(yī)學部，附設大學醫(yī)院、牙癥醫(yī)院，蔡翹任院長。1951年2月南京大學醫(yī)學院劃歸中國人民解放軍南京軍區(qū)領導，醫(yī)學院附設醫(yī)院更名為解放軍第84醫(yī)院。

1952年南京大學醫(yī)學院改名為中國人民解放軍第五軍醫(yī)大學。1954年9月第五軍醫(yī)大學遷往西安，與第四軍醫(yī)大學合并，留下部分教師及附屬醫(yī)院與三所軍隊醫(yī)科學校組建成第六軍醫(yī)學校。1958年7月總后勤部將第六軍醫(yī)學校及附屬醫(yī)院移交鐵道部，改建為南京鐵道醫(yī)學院。醫(yī)'學教育網(wǎng)|整理2000年4月14日，根據(jù)國務院的決定，南京鐵道醫(yī)學院與東南大學合并成立新的東南大學，原南京鐵道醫(yī)學院附屬醫(yī)院改為東南大學附屬中大醫(yī)院，醫(yī)學院成為綜合性大學的一個重要組成部分，是醫(yī)學學科、生命學科、生物與醫(yī)學工程學科優(yōu)秀人才和創(chuàng)新成果的培育基地、醫(yī)療衛(wèi)生服務基地和江蘇省生物醫(yī)藥研發(fā)孵化創(chuàng)業(yè)中心。

東南大學醫(yī)學院在丁家橋校區(qū)73年的辦學歷史中，大師云集、人才輩出：像潘銘紫、蔡翹、戚壽南先生等一批聲名卓著的醫(yī)學名家和教育家，就曾在這片土地上工作或學習過。改革開放以來，醫(yī)學院為祖國培養(yǎng)了像賀林院士、楊煥明院士、黃鋼、樊佳教授等大批優(yōu)秀的高級醫(yī)學人才，為國家的醫(yī)療衛(wèi)生事業(yè)作出了貢獻。