黑龍江省中醫(yī)醫(yī)院前身是成立于1957年的黑龍江省祖國醫(yī)藥研究所，是全國成立最早的省級中醫(yī)藥科研醫(yī)療機構之一。

1985年更名為“黑龍江省中醫(yī)研究院”醫(yī)學|教育網|搜集整理。為了充分發(fā)揮我院的中醫(yī)醫(yī)療優(yōu)勢。

1995年經黑龍江省編委批準加掛了“黑龍江省中醫(yī)醫(yī)院”的牌匾，同年被評為三級甲等中醫(yī)醫(yī)院；現已發(fā)展成為集醫(yī)療、科研和研究生教育于一體的綜合性中醫(yī)藥科研醫(yī)療機構2001年先后被確定為黑龍江省和哈爾濱市的城鎮(zhèn)職工醫(yī)療保險定點醫(yī)院。

2004年獲得衛(wèi)生部、人事部、國家中醫(yī)藥管理局聯(lián)合授予的“全國衛(wèi)生系統(tǒng)先進集體”和黑龍江省委授予的“全省小康建設百面紅旗集體”榮譽稱號。

2008年被國家中醫(yī)藥管理局確定為重點中醫(yī)院建設項目單位。