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根據微生物實驗室開展工作的性質、接觸的病原體生物危害程度、采取生物安全措施的不同，臨床生物安全實驗室共分為4個等級：

1級生物安全實驗室(BSL-1)：為基礎實驗室，主要從事基礎教學與研究，接觸1級生物危害微生物，只需開放式長形工作臺和好的微生物操作技術。

2級生物安全實驗室(BSL-2)：也為基礎實驗室，從事實驗健康服務、診斷、研究、接觸2級生物危害微生物，即引起人動物發(fā)病但不會引起嚴重危害的病原體。除了開放式長形工作臺還應配置生物安全柜。

3級生物安全實驗室(BSL-3)：為遏制實驗室，從事特殊診斷與服務，接觸3級生物危害微生物，即引起人或動物嚴重疾病但通常不因偶然在個體間傳播，有治療方法的病原體，需要生物安全柜和其他操作所需的基本裝置，實驗室應有生物危害標記，操作人員身著特殊防護服，有好的微生物操作技術。人員進入受限，實驗室內有定向氣流。

4級生物安全實驗室(BSL-4)：為嚴格遏制實驗室。從事危險病原體操作。接觸4級生物危害微生物，即引起人類或動物非常嚴重的疾病，能在人與人、人與動物之間造成傳播，尚無有效治療和預防方法的病原體。實驗室應有配套的生物安全柜，人員身著帶正壓的連衣褲，實驗室空氣經過濾，配備帶雙門的高壓滅菌器，除了三級防護措施外，人員進入實驗室時，應經過密封的過渡艙，離開時應經風淋，生物廢棄物應經特殊處理。

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