HIV基因組有2條相同的正鏈RNA長約9.7kb，在基因組的5端和3端均有一段相同的核苷酸序列，稱長末端重復(fù)序列（LTR），HIV的主要基因結(jié)構(gòu)和組合形式與其他反轉(zhuǎn)錄病毒相同，但因它有較多的調(diào)節(jié)基因，所以HIV較其他反轉(zhuǎn)錄病毒更復(fù)雜，LTR中間含3個(gè)結(jié)構(gòu)基因，3個(gè)調(diào)節(jié)基因及數(shù)個(gè)輔助基因。為最大限度利用有限的基因，HIW-I基因編碼區(qū)有很多重疊，尤其在基因組3端。其部分基因如tat和rev是不連續(xù)的，被插入的內(nèi)含子分隔成2個(gè)外顯子醫(yī)學(xué)`教育搜集整理。