按照抗原分子的化學性質，可將抗原分成蛋白抗原、多糖抗原和核酸抗原等許多類型。

　　天然蛋白質的分子組成都比較復雜，且具有二級和三級結構，醫(yī)|學教育網搜集整理因此多是良好的抗原。多糖的免疫原性一般較弱，但某些結構復雜的多糖，例如人類ABO血型抗原等，也具有較強的免疫原性。核酸和脂類多無免疫原性，與蛋白質結合后形成核蛋白或脂蛋白時可成為良好的抗原；在系統(tǒng)性紅斑狼瘡等自身免疫病患者體內可發(fā)現抗DNA或抗RNA的抗體，所以核酸也許是一種天然的半抗原。