生殖器官，準確的說，是指在復雜生物體上任何與有性繁殖及組成生殖系統(tǒng)有關的組織（嚴格意義上，不一定都屬于器官）。

人類及大部分哺乳動物的生殖器官主要有：

男性（雄性）：陰莖、睪丸、附睪、陰囊、前列腺、精液、尿道球腺等

女性（雌性）：陰蒂、陰道、陰唇、子宮、輸卵管、卵巢、前庭小腺、前庭大腺等

另外有相關的性器官一詞，廣義的說是指會帶來性快感的器官。生殖腺是指產生配子的器官。在人類身上是指睪丸與卵巢。

植物的生殖器官

孢子植物孢子體的雌性生殖器官為頸卵器，雄性生殖器官為精子器。 種子植物的花、果實或種子。雄性生殖器官為雄蕊，雌性生殖器官為雌蕊。 但植物的繁殖不一定依賴這些器官或組織。