在小腸中，多種酶參與了蛋白質(zhì)的分解過程。這些酶主要來源于胰腺分泌的消化液和小腸自身的細(xì)胞分泌物。具體來說，涉及的主要有：
1. 胰蛋白酶（Trypsin）：這是一種從胰腺分泌出來的絲氨酸蛋白酶，能夠特異性地在賴氨酸或精氨酸殘基羧基側(cè)的肽鍵處切割蛋白質(zhì)分子。
2. 胰凝乳蛋白酶（Chymotrypsin）：同樣是由胰腺產(chǎn)生的另一種絲氨酸蛋白酶，它傾向于在苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸等芳香族氨基酸殘基的羧基側(cè)切斷肽鏈。
3. 彈性蛋白酶（Elastase）：這種酶也由胰腺產(chǎn)生，主要作用于較小的中性脂肪酸與甘油酯之間的酯鍵，但在蛋白質(zhì)消化過程中也能對某些特定位置進(jìn)行有限度的切割。
4. 羧基肽酶A和B（Carboxypeptidases A and B）：這兩種酶也是從胰腺分泌而來，它們分別作用于羧基末端為疏水性和堿性氨基酸殘基的多肽鏈上，逐個去除這些末端氨基酸。
5. 腸激酶（Enterokinase）或腸肽酶（Enteropeptidase）：由小腸粘膜細(xì)胞產(chǎn)生的一種蛋白酶，可以激活胰腺分泌出來的前體形式的胰蛋白酶原，使其轉(zhuǎn)化為活性狀態(tài)下的胰蛋白酶。
6. 氨基肽酶和羧基肽酶：這些是由小腸上皮細(xì)胞產(chǎn)生的表面酶，能夠進(jìn)一步分解已經(jīng)部分水解的小分子多肽，直至產(chǎn)生單個氨基酸或二肽、三肽等更小的單位。

上述各種酶共同協(xié)作，在小腸內(nèi)完成對食物中蛋白質(zhì)的徹底降解過程。