鹽析法分離蛋白質(zhì)主要依據(jù)的是蛋白質(zhì)在溶液中的溶解度受到鹽濃度的影響。當(dāng)向含有蛋白質(zhì)的水溶液中加入一定量的中性鹽（如硫酸銨、氯化鈉等）時(shí)，隨著鹽濃度的增加，蛋白質(zhì)分子表面的電荷被屏蔽，減少了蛋白質(zhì)與水分子之間的相互作用，導(dǎo)致蛋白質(zhì)分子之間的疏水部分更容易相互接觸和聚集，從而降低其在水中的溶解度。當(dāng)達(dá)到某一特定的鹽濃度時(shí)，蛋白質(zhì)就會(huì)從溶液中析出形成沉淀。

這個(gè)過程可以分兩個(gè)階段來看：首先是在低鹽濃度下，隨著鹽濃度逐漸增加，蛋白質(zhì)的溶解度會(huì)先有一個(gè)短暫的上升；這是由于加入少量的鹽能破壞水分子之間的氫鍵網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)，使原本被水化層包圍著的蛋白質(zhì)表面暴露出來。但是當(dāng)繼續(xù)增加鹽濃度時(shí)，電荷屏蔽效應(yīng)占據(jù)主導(dǎo)地位，導(dǎo)致蛋白質(zhì)之間相互吸引并聚集形成大顆粒而沉淀下來。

利用這一特性，在實(shí)際操作中可以通過調(diào)節(jié)溶液中的鹽濃度來控制不同種類或大小蛋白質(zhì)的分離和純化過程。