牙源性囊腫和非牙源性囊腫的主要區(qū)別在于它們的發(fā)生部位、病因以及病理特點。

首先，從發(fā)生部位來看，牙源性囊腫通常與牙齒的形成和發(fā)展有關(guān)，主要發(fā)生在上下頜骨中。而非牙源性囊腫的發(fā)生則不局限于頜面區(qū)域，可以出現(xiàn)在身體的其他部位，但當(dāng)其發(fā)生在口腔頜面部時，可能與唾液腺、血管等組織相關(guān)。

其次，在病因方面，牙源性囊腫多由牙齒發(fā)育過程中的異常引起，如未萌出的智齒周圍形成的含牙囊腫，或者是由于根尖周病導(dǎo)致的根尖囊腫。而非牙源性囊腫的原因則更加多樣，可能與先天因素、炎癥反應(yīng)、外傷或腫瘤等有關(guān)。

最后，從病理特點上講，牙源性囊腫內(nèi)部多含有液體或者半固體物質(zhì)，并且其壁通常包含有上皮細(xì)胞層，這些上皮細(xì)胞可以是牙板殘余的鱗狀上皮或者是成釉器的星網(wǎng)狀層。而非牙源性囊腫的結(jié)構(gòu)較為復(fù)雜，可能包括纖維組織、腺體組織等不同成分，具體取決于囊腫的具體類型。

總之，牙源性和非牙源性囊腫在臨床表現(xiàn)、診斷方法及治療方案等方面都有所差異，在實際診療過程中需要結(jié)合患者的具體情況進(jìn)行綜合判斷。