維持蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)的主要力量有四種，分別是氫鍵、疏水作用、離子鍵和二硫鍵。這些力量共同作用，使蛋白質(zhì)形成特定的空間構(gòu)象。
1. 氫鍵：在蛋白質(zhì)中，肽鏈上的羰基氧原子與氨基氫原子之間可以形成氫鍵。此外，側(cè)鏈之間的某些基團(tuán)也可以通過(guò)氫鍵相互作用，幫助穩(wěn)定蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)。
2. 疏水作用：疏水性氨基酸殘基傾向于聚集在蛋白質(zhì)分子內(nèi)部，遠(yuǎn)離水環(huán)境，這種趨勢(shì)有助于蛋白質(zhì)折疊成特定的形狀。疏水作用是蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)形成的重要驅(qū)動(dòng)力之一。
3. 離子鍵（或稱(chēng)為鹽橋）：帶正電荷和負(fù)電荷的氨基酸側(cè)鏈之間可以形成離子鍵。這些靜電相互作用對(duì)穩(wěn)定某些蛋白質(zhì)構(gòu)象特別重要，尤其是在酶活性中心等特定區(qū)域。
4. 二硫鍵：當(dāng)兩個(gè)半胱氨酸殘基靠近時(shí)，它們的巰基（-SH）可以通過(guò)氧化反應(yīng)形成一個(gè)穩(wěn)定的共價(jià)連接——即二硫鍵（-S-S-）。這種強(qiáng)而持久的化學(xué)鍵在許多蛋白質(zhì)中起著重要的穩(wěn)定作用。

這些力量相互協(xié)作，在不同層次上影響著蛋白質(zhì)分子的空間排列和穩(wěn)定性。