在配對設(shè)計的研究中，卡方（χ2）檢驗的主要目的通常是為了評估兩組配對樣本之間的差異是否具有統(tǒng)計學(xué)意義。這里所說的“配對”，指的是每一對樣本之間存在某種聯(lián)系或匹配關(guān)系，比如同一個人在不同時間點的測量值、同一家庭成員的不同個體、或者實驗前后的比較等。這種設(shè)計能夠有效控制混雜因素的影響，提高研究結(jié)果的準(zhǔn)確性。

具體到卡方檢驗的應(yīng)用上，在配對設(shè)計中，我們通常會關(guān)注的是兩組樣本在某一分類變量上的分布是否存在顯著差異。例如，在一項關(guān)于某種疫苗效果的研究中，如果采用配對設(shè)計，可能會將同一批受試者分為實驗組（接種疫苗）和對照組（不接種或接種安慰劑），然后觀察并記錄這兩組人群在一定時間后是否出現(xiàn)目標(biāo)疾病的情況。通過卡方檢驗，可以評估接種與未接種之間患病率的差異是否有統(tǒng)計學(xué)意義。

需要注意的是，在進(jìn)行配對設(shè)計的χ2檢驗時，數(shù)據(jù)處理方式和獨立樣本的卡方檢驗有所不同。對于配對資料，需要特別關(guān)注每一對樣本之間的變化情況（如從“陰性”轉(zhuǎn)為“陽性”的數(shù)量等），并據(jù)此構(gòu)建合適的列聯(lián)表來進(jìn)行統(tǒng)計分析。

總之，通過在配對設(shè)計中使用χ2檢驗，研究者能夠更準(zhǔn)確地評估處理因素的效果，同時控制其他潛在干擾變量的影響。這對于公共衛(wèi)生領(lǐng)域的許多研究都具有重要意義，比如疾病預(yù)防措施的有效性評價、健康干預(yù)項目的成效檢測等。