蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)是指多肽鏈主鏈原子的局部空間排布，不涉及側(cè)鏈構(gòu)象。主要的形式有四種：
1. α-螺旋（Alpha Helix）：α-螺旋是由一條多肽鏈圍繞一個(gè)中心軸以右手螺旋的方式盤旋上升形成的結(jié)構(gòu)，每3.6個(gè)氨基酸殘基旋轉(zhuǎn)一周，螺距為0.54納米。氫鍵沿著螺旋的長(zhǎng)軸方向形成，穩(wěn)定了這種結(jié)構(gòu)。
2. β-折疊（Beta Sheet）：β-折疊是由兩條或多條幾乎完全伸展的多肽鏈通過(guò)鏈間氫鍵相連形成的平面或彎曲的片狀結(jié)構(gòu)。根據(jù)鏈的方向可以分為平行式和反平行式兩種類型，其中反平行式的穩(wěn)定性更高。
3. 轉(zhuǎn)角（Turns）：轉(zhuǎn)角是連接兩個(gè)二級(jí)結(jié)構(gòu)元件的小段序列，通常由3-4個(gè)氨基酸殘基組成。最常見的有β-轉(zhuǎn)角和γ-轉(zhuǎn)角等，它們可以改變多肽鏈的方向，有助于形成更復(fù)雜的三維構(gòu)象。
4. 無(wú)規(guī)卷曲（Random Coil）：指那些不能歸類為上述三種規(guī)則結(jié)構(gòu)的區(qū)域，這些部分沒(méi)有固定的折疊模式，呈現(xiàn)出較為松散的狀態(tài)。雖然稱為“無(wú)規(guī)”，但在某些情況下仍可能對(duì)蛋白質(zhì)的功能產(chǎn)生重要影響。

這些二級(jí)結(jié)構(gòu)元素通過(guò)不同的組合方式構(gòu)成了蛋白質(zhì)更為復(fù)雜的三級(jí)和四級(jí)結(jié)構(gòu)。