天然醌類化合物廣泛存在于多種植物中，它們在自然界中的分布較為普遍。這類化合物主要可以在以下幾個類型的植物中找到：
1. 柿科植物：如柿子樹等，其根、莖、葉和果實中含有較多的醌類成分。
2. 茜草科植物：例如茜草（用于提取天然染料）、梔子等，這些植物中的醌類化合物具有一定的藥用價值。
3. 唇形科植物：如丹參、紫蘇等，含有多種生物活性醌類物質，在傳統(tǒng)醫(yī)藥中有廣泛應用。
4. 豆科植物：部分豆科植物也含有一些重要的醌類成分，例如黃芪就含有一定量的異戊二烯化醌。

此外，還有一些其他科屬的植物也可能含有天然醌類化合物，比如菊科、蓼科等。在研究和利用這些植物資源時，需要結合具體物種及其部位進行分析檢測，以確保準確獲取目標化合物。